Banvallen
Det ställs höga krav på banan när den färdig kommer att trafikeras både med tunga godståg och med snabbtåg i hastigheter upp till 250 km/h.
Banvallen byggs upp av sprängsten med en spårballlast av makadam.
Slipers och räl
Själva spåret byggs upp av betongsliprar med gummimellanlägg och fjädrande befästning och ett avstånd av 600 mm samt långräler av UIC 60 material max 400 m (brännsvetsade). Dessa räler svetsas sen ihop ute i spåret med termitsvetsning. Spårvidden är 1435 mm likt största delen av Europa.
Spårväxlar byggs av UIC 60 material på betongsliprar, och kommer i huvudspåret att vara försedda med rörlig korsningsspets.
Helsvetsat spår
Här uppe i norra Sverige är det stor temperaturskillnad mellan sommar och vinter vilket gör det ytterst viktigt att fästa det helsvetsade spåret i en bestämd temperatur. Är temperaturen inte den rätta vid byggandet måste man kapa av och lossa rälen och ge den rätt temperatur genom förlängning eller förkortning (neutralisering). Ett femtontal broar kommer att förses med dilatationsanordningar vid broarnas rörliga lagring för att uppta längsgående rörelser för spår respektive bro.
Kabelkanalisation
För att få en enkel och skyddad förläggning av kablar kommer kabelrännor av betong i olika storlekar att anläggas utefter hela Botniabanan. Till dessa kabelrännor ansluts objekt utmed banan med olika typer av rännor.
När man skall korsa spåret med kablar läggs plaströr genom banvallen på ett djup av minst 1200 mm och som ansluts till betongbrunnar på ömse sidor om spåret.