Banverket (numera Trafikverket) har ansvarat för utrednings- och planeringsarbetet runt Botniabanan.
Botniabanan AB har ansvarat för byggandet av den nya järnvägen. Ägandet i bolaget fördelas enligt följande:
Staten, via Näringsdepartementet, äger 91 procent.
De berörda kommunerna i regionen äger resterande 9 procent tillsammans.
Kramfors kommun, 2,25 procent
Örnsköldsviks kommun, 2,25 procent
Nordmalings kommun, 2,25 procent
Umeå kommun, 2,25 procent
Ansvarsområden
Botniabanan AB har ansvarat för att finansiera, detaljprojektera, upphandla, bygga, ta banan i provdrift samt hyra ut anläggningen.
Banverket har ansvarat för utredningar, järnvägsplaner, tillstånd, marklösen, övertagit ansvaret för den färdiga anläggningen samt hyr anläggningen sedan den tagits i drift.
Kommunerna har ansvarat för att anpassa översikts- och detaljplaner för Botniabanebygget, utreda, bygga och driva resecentrum, samt att tillsammans med Länstrafiken trafikera järnvägen.